在美国驻肯、坦两使馆发生爆炸的当天，巴基斯坦情报部门在卡拉奇国际机场逮捕了一名32岁的男子穆罕默德·萨迪克·欧登。欧登持伪造的也门护照，他企图利用行贿海关人员的手段混人巴基斯坦。
欧登被捕后，向巴基斯坦警方坦白了他在内罗毕爆炸一案中的所做所为。他说他是一个由7人组成的伊斯兰激进团体的成员，他们的活动经费由拉登供给，他们这次为制造美国大使馆爆炸案的“同志”提供了技术帮助，所用的开销全部是拉登资助的，欧登负责技术工程。
据报道，欧登曾是出生于约旦的巴勒斯坦工程师。1990年在阿富汗结识拉登，之后于1994年被派往肯尼亚，从事在非洲在的反美活动。
萨迪克·欧登供认，他原籍巴勒斯坦，其余参与这两起爆炸案的人都已安全越过巴基斯坦边境进入阿富汗，他们将在那里与拉登会合。在非洲两起大爆炸案发生之前，他们接到严厉的密令：互相协助，尽快从肯尼亚撤离，到卡拉奇静候消息。
欧登还承认，他曾在菲律宾和约旦多次执行拉登的指令。
欧登被捕后于8月7日被引渡到肯尼亚，然后再从肯尼亚引渡到了美国。巴基斯坦外交部长在星期四的记者招待会上说：“我们会尽我们的责任继续与恐怖主义斗争，在这个方面我们会继续扮演积极的角色。”
在问及拉登的问题时，巴外长说：“如果拉登真的卷入恐怖主义行动，我们是不会支持他的这种行为的。”但当记者问他，是否美国要求巴基斯坦采取特殊行动协助追捕拉登时，他又环顾左右而言它，回答仅仅是：“我们已经讨论过这个问题了。”
联邦调查局还与肯尼亚警方合作，逮捕了炸弹攻击美国大使馆的另一名嫌疑犯——本·拉登的同伙穆罕默德·欧哈里，欧哈里也是在爆炸当天被捕的。当时他在内罗毕乘坐着一辆装满炸药的卡车，打算在爆炸中自杀。他被认出是爆炸前几天在大使馆门前摄像的那个人。同时有人认出，他向大使馆保安投掷炸弹。
欧哈里向美国联邦调查局详细交代了他的情况，他曾在阿富汗的训练营接受过爆炸、劫机、绑架的训练。
9月7日，菲律宾警方也逮捕了两名属于拉登恐怖主义网络的疑犯。据《马尼拉时报》报道，这两人是在周一早上于尼洛国际机场被捕的，当时他们持有伪造的希腊护照、
据说假护照是他们在曼谷花2000美元买的，他们使用真名登机，在下飞机时换上假护照，机场方面报告没有任何希腊乘客的记录。
当时机场安全工作极其严密，因为警方接到的情报说，有4名拉登手下将持欧洲旅游护照入境，警方还怀疑这两人参与策划了炸毁马尼拉的美国大使馆。
9月初，有人在一架降落于科威特的飞机上的洗手间里发现一张纸条。纸条的内容是威胁要炸毁马尼拉的美国大使馆，上面用英文写着：“菲律宾的美国大使馆将于1998年9月4日爆炸。”
这家大使馆几周来一直处于警戒状态。
那几天来一直接到威胁信的海景酒店也实施了严格的防范措施，这家五星级的大酒店向安全人员提交了一份备忘录，备忘录上印有60名恐怖主义嫌疑犯的姓名与照片。
被捕的还有穆罕默德·萨利姆和瓦迪·艾尔哈基。9月19日，《华盛顿邮报》引述美国政府人士的谈话报导，德国警方已于16日逮捕了本·拉登的激进伊斯兰教组织的一名主要成员，美国官员也已在纽约秘密对此人提起刑事诉讼。邮报指出，逮捕这名涉嫌的恐怖分子，是最近执法当局对效忠本·拉登的全球组织所采取的一连串行动的一部分。
消息人士说，此人名叫马姆杜·穆罕默德·萨利姆。萨利姆是拉登手下的高级军官。德国反恐怖主义警察在接到美国特工的线报后将他逮捕。他被指控为拉登的财政副手，并负责对拉登的手下进行训练和装备。
萨利姆还成立了在阿富汗。巴基斯坦和苏丹的恐怖主义训练营，并试图获取非常规武器，包括核武器部件。
据《华盛顿邮报》报导，联邦调查局和中央情报局都曾协助巴伐利亚警方逮捕萨利姆，一名美国官员说他是本·拉登的主要金融助手，同时也协助采购武器。
这位官员又说：“这是一项重大的逮捕行动，对本·拉登的组织是一大打击——虽然不会消除他的组织，但是当他失去一名高级成员之后，这是一项冲击……这里的人都非常高兴。”
美国司法部门的官员表示，寻求逮捕萨利姆的秘密拘票是最近在曼哈顿提出的，但是他们拒绝说明萨利姆是否为炸弹攻击美国驻东非大使馆的嫌犯之一。
9月16日晚间，联邦调查局逮捕了一度担任过本·拉登私人秘书的一名德克萨斯州男子瓦迪·艾尔哈基。瓦迪·艾尔哈基是住在德克萨斯的美国公民，他在流亡苏丹期间担任过拉登的私人秘书。他被指控对美国联邦调查局撒谎，有证据证明他参与了大使馆爆炸案。
17日下午，联邦检察官也公布了对本·拉登的另一名同伙提起的刑事诉讼，他涉嫌协助执行用炸弹攻击美国驻内罗毕大使馆的行动，目前仍然在逃。
乌干达警方在9月中旬逮捕了18名属拉登恐怖主义网络的嫌疑分子。据乌干达政府报纸报道，地方安全官员指认其中两人涉嫌内罗毕和达累斯萨拉姆美国大使馆的爆炸案，美国联邦调查局官员随即前往乌干达侦讯这些嫌犯。
乌干达是在接到美国情报后于9月17和18日逮捕了这18人的，警方怀疑他们策划袭击坎普拉的美国大使馆。据报道，警方搜查出大量炸药，其中一个炸弹竟有一吨重。
被捕者向警方举报了其他在坎普拉和邻近地区的同党。警方在其中几位身上搜出一些关于恐怖主义团体活动的书面材料，其中一位嫌疑分子是一个穆斯林慈善团体的财政秘书。
9月底，英国警方在一次反恐怖主义的联合行动中，也逮捕了7名属于拉登网络的嫌疑犯。据英国广播公司（bbc）报道，此7人有“中东血统”。
这次逮捕的7人中，其中一人名叫艾尔·法瓦兹，据说是沙特异党分子驻伦敦的代表。在最近的一次采访中，法瓦兹申称自己与拉登相交甚密。他认为拉登是一个“智慧而和善的人”。
根据英国法律，这些嫌疑犯可在没有控诉罪名以前，接受4天的询问。苏格兰法院声称，英国新法不适用于这次逮捕。新法中规定，在国外策划恐怖主义行动在英国也是一项犯罪，而这次是根据1989年的反恐怖主义法对此7人进行逮捕的。
不管新法是否适用于这次逮捕，英国方面保证，恐怖主义团体将比以前更难在英国找到安全的土壤。目前英国约有400个穆斯林组织，其中一些与恐怖组织有关的正在接受调查。
此外，美国国务院和联邦调查局并已悬赏两百万美元，缉捕被控攻击美国驻肯尼亚大使馆的另一名本·拉登信徒哈隆恩·法兹尔，法兹尔被控在内罗毕爆炸案中起关键作用。
据报道，法兹尔在炸弹组装地租了一幢别墅，并在那里策划袭击行动。爆炸发生一周后，他设法在联邦调查局找到他住所以前，乘飞机逃走。他现在藏身于阿富汗。
这些被捕者透露了拉登庞大的世界范围的恐怖主义网络，他们的同党遍及西方国家及中东和非洲。这些国家或地区包括：苏丹、沙特、也门、索马里、阿富汗。巴基斯坦、波斯尼亚、克罗地亚、阿尔及利亚、突尼斯、黎巴嫩、菲律宾、塔吉克斯坦、克什米尔、肯尼亚、美国等。
这些行动表明，美国试图摧毁拉登在世界范围的恐怖主义网络的行动已初见成效。从目前取得的进展看，这些努力并不只局限于军事领域，美国最大的成功是在情报与国际合作方面。尽管最近的反恐怖主义行动取得了重大进展，然而这对拉登今后将要采取行动的能力有多大影响并不明确。但无论如何，这些进展象征着国际间合作可取得怎样的成果。
国际恐怖主义的毒菌在世界各地的蔓延，引起了各国政府和国际社会的普遍关注和忧虑。一时间，研究恐怖主义问题成了一项热门学问。一批研究机构应运而生，一批学术著作和论文相继问世。不少专家从政治学、法律学、军事学、社会学、行为学、心理学等不同角度探讨了恐怖主义产生的根源及特点，为解决恐怖主义问题出谋划策。
受到国际恐怖主义威胁的各国政府日益把对付恐怖主义作为一项重要的工作。不少国家新执政的政党和领导人都把解决恐怖主义问题作为自己的施政目标，恐怖主义成为各国政府志在必除的心腹之患。在各国政府的努力下，一支支令恐怖分子闻风丧胆的特种部队建立起来了，一项项打击恐怖分子的法令与政策措施开始执行了，近20年来，暗杀、绑架、劫持人质等侵害人身安全和自由的国际恐怖事件不断发生。为了防止和惩治这类恐怖活动，国际上制订了一些条约，其中属于区域性的有：1971年2月2月签订的《美洲国家组织关于防止和惩治恐怖主主行为公约》；1976年10月10日签订的《欧洲制止恐怖主义条约》。属于普遍性的有：1973年签订的《关于防止和惩处侵豁应受国际保护人员包括外交代表的罪行的公约》；1979年通过的《反对劫持人质的国际公约》……这些都有效地遏制了恐怖主义无限上升的势头。